2.1传统提取方法 
传统的提取方法是酸碱处理法，制备胶原蛋白的工艺是：原料→预处理→酸处理→碱处理→熬胶→胶液过滤→浓缩→切片→干燥→成品。
将鱼鳞洗净，必要时要进行脱脂脱色，然后用盐酸浸泡进行脱钙处理，直到鳞片柔软透明；取出洗净后浸灰，主要是使得原料组织疏松。洗净后放在夹层锅中加热熬胶，提尽为止。趁热转盘，凝固成胶冻，干燥后使含水量＜15%，即得成品。然而，传统的提取方法步骤繁多，耗时长且在提取过程中胶原蛋白流失较大，不适于大规模的生产。
2.2 酸提取法  
酸提取法即是利用酸在一定的外界环境条件下提取胶原蛋白，使用的酸有盐酸、柠檬酸、乳酸、醋酸等。
利用乙酸从鲤鱼鱼鳞中提取胶原蛋白，经过响应面分析实验得到最佳提取工艺。在提取过程中发现，乙酸浓度过高反而会使胶原蛋白的提取率有下降的趋势，主要原因是较高的乙酸浓度会增加胶原蛋白的溶解速率，使提取液的黏度迅速增大，反而不利于后期的提取。
分别用醋酸、柠檬酸、乳酸来提取草鱼鱼鳞的胶原蛋白，结果表明柠檬酸提取胶原蛋白的得率最高，乳酸次之，醋酸最低。
总体上说，酸提取胶原蛋白在前处理中不能用酸进行处理，因而有部分杂蛋白难以去除，在后续提取得到的胶原蛋白含杂蛋白较多，从而就增大了胶原蛋白纯化的工作量。酸提取方法步骤过于繁琐，在常温下提取，大量胶原蛋白损失。
2.3 酶提取法  
酶法制备即是利用各种不同的酶在一定的外界环境条件下提取胶原蛋白，常采用的酶有中性蛋白酶、木瓜蛋白酶、胰蛋白酶、胃蛋白酶等。原料经过前处理后加入不同的酶提取得到酶促溶性胶原蛋白。
采用碱性蛋白酶酶解鱼鳞，得到的鱼鳞水解蛋白有很好的吸水性、乳化性、起泡性和溶解性。
以乙酸为胃蛋白酶的溶剂酶解鱼鳞提取胶原蛋白，由于乙酸也可以水解胶原蛋白，因此，此方法提取得到的胶原蛋白既有酶溶性的也有酸溶性的。但是实验的提取的时间太长，不适于工业生产。
比较了多种酶(枯草杆菌蛋白酶、胰蛋白酶、木瓜蛋白酶)在其各自的最佳条件下对胶原蛋白的水解情况，而利用混合酶水解在相同的时间内水解度较高。虽然多酶的水解度高，但成本太高，同样不利于大规模的生产加工。
在酶水解提取中，还存在一个问题，随着酶的水解作用，在水解产物中容易有苦肽的出现。并且研究发现水解度与苦味肽的生成呈线性关系，因此不难推想，选择合适的水解度可有效控制苦味肽的生成。因而，在酶法提取胶原蛋白中找到一个水解度又高，苦肽生成量又少的点是至关重要的。
2.4 微生物发酵提取法  
用枯草芽孢杆菌发酵后将上清液经膜系统分离，然后将精制液进行真空浓缩至浓度，然后喷雾干燥得鱼鳞胶原蛋白肽粉末成品，此法技术上尚不成熟，但有研究前景，微生物发酵方法是现代提取方法的热门话题。
2.5 热水处理法 
热水提取就是原料经过各种前处理后在一定条件下用热水浸提，从而得到水溶性胶原蛋白的方法。
鱼鳞水法制胶的最佳温度在60～70℃。温度高些有助于提胶，但温度过高抽提率还有所下降。超过70℃后，所制得的鱼鳞胶的固含量反而会有降低的现象，随着固含量的降低，鱼鳞胶的折光率和增比黏度都会降低，导致鱼鳞胶的质量有所下降。液比(鱼鳞与水的质量比)越小，所制得的胶黏度越高，鱼鳞胶的质量也相对好；可是液比太小抽提胶困难，抽提率小。因此抽提鱼鳞胶的液比以1∶1～1∶1.5为最好。
在比较热力法和酶解法提取鱼鳞胶原蛋白中，热力法的提取率比酶解法高，并且热力法提取的胶原蛋白有较高的保水性、乳化能力和乳化稳定性及泡沫稳定性。

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